Wykorzystując strategię transkrypcji przestrzennej do oceny dziesiątek tysięcy miejsc w normalnych i złośliwych tkankach w całych narządach, naukowcy uzyskali nowy wgląd we wczesny rozwój raka. Co ciekawe, naukowcy zidentyfikowali obszary przypuszczalnie zdrowej tkanki, które faktycznie kryją wiele genetycznych cech raka.
W raporcie z pracy autorzy napisali: „Określenie przejścia od tkanki łagodnej do złośliwej jest kluczem do poprawy wczesnej diagnostyki raka”. Opublikowany w charakter temperamentu. „Nasze wyniki sugerują model przedstawiający niestabilność genetyczną w histologicznie łagodnych tkankach, które mogą reprezentować wczesne zdarzenia w rozwoju raka”.
Badanie zostało przeprowadzone przez dr Alistaira Lamba z Wydziału Nauk Chirurgicznych Nuffield w Oksfordzie i dr Joachima Lundberga z Królewskiego Instytutu Technologii KTH i zostało sfinansowane przez Cancer Research UK.
Zespół wykorzystał strategię transkrypcji przestrzennej, aby wywnioskować zmiany liczby kopii (CNV) w ponad 120 000 regionach tkanek łagodnych i złośliwych w wielu narządach. CNV to specyficzne fragmenty DNA, które są duplikowane lub usuwane w różnych komórkach.
„[When CNVs] Występują w komórkach i są również niezawodnie przenoszone do komórek potomnych podczas podziału” – wyjaśnił Lamb. [CNVs] Jest to przydatny marker do identyfikacji „klonów” – grup komórek o wspólnym dziedzictwie genetycznym. „
Co więcej, zysk lub utrata segmentu DNA może wzmocnić lub zmniejszyć ekspresję genów zakodowanych w tym segmencie. „jeśli [a CNV encodes] Lamb wyjaśnił, że białko supresorowe guza i transkrypty genów są tracone, co powoduje ich mniejszą produkcję, co może prowadzić do raka.
„Siła w badaniu różnorodności populacji polega na skanowaniu całego genomu pod kątem zysków i strat w regionach genomowych” – dodał Lundberg. „Zrobiliśmy to szeroko, odkąd przeanalizowaliśmy tysiące obszarów w jednym skrawku tkanki”.
Skupić się na prostataZespół badawczy zidentyfikował wzorce klonalne w rakowych i nienowotworowych obszarach narządu. „W szczególności przeprowadziliśmy dogłębną analizę przestrzenną narządu prostaty, która wytworzyła bezprecedensowy atlas obejmujący do 50 000 prążków tkankowych u jednego pacjenta i 120 000 prążków tkankowych u dziesięciu pacjentów” – napisali.
„[Our] „Ujawnił kilka zaskakujących wyników”, powiedział Lamb w komunikacie prasowym. „Na przykład odkryliśmy, że wiele zdarzeń dotyczących liczby kopii, które wcześniej uważaliśmy, że były szczególnie związane z rakiem, jest już obecnych w łagodnej tkance”.
Potwierdzili swoją analizę na próbce raka piersi, części skóry, węzła chłonnego i części tkanki mózgowej. „my [show] że w niektórych typach guzów, szczególnie w prostacie, glejaku i raku piersi, analiza CNV identyfikuje różne wzorce klonalne w obrębie guzów” – napisali.
Sugerujemy, że CNV mogą poprzedzać nowotworzenie [and] Niewystarczające, aby zapewnić natychmiastową wirtualną transformację”. [altered benign] Komórki mogą reprezentować stan pośredni między komórkami łagodnymi a złośliwymi”.
Zespół ma pewne plany, aby posunąć biznes do przodu. „Naszym bezpośrednim następnym krokiem jest określenie składu klonalnego niewielkiej liczby komórek, które rozprzestrzeniły się do węzłów chłonnych, pierwszego punktu rozprzestrzeniania się u mężczyzn z rakiem prostaty, oraz określenie, z których klonów te komórki pochodzą z prostaty” – Lamb powiedział. . „Wiemy, że jedynymi komórkami raka prostaty, które naprawdę się liczą, są te, które mają potencjał do rozprzestrzeniania się”.
Planują również zbadać cały ekosystem gruczołu krokowego. „Istnieje duże zainteresowanie zrozumieniem ekosystemu na przestrzeni czasu – uzyskaniem czasoprzestrzennej mapy choroby prostaty” – powiedział Lundberg.
„Z technicznego punktu widzenia chcielibyśmy również dodać do naszej analizy dodatkowe modalności przestrzenne, takie jak epigenetyka i proteomika” – powiedział. Pomoże im to wyjaśnić bardzo wczesne zdarzenia molekularne w zdrowych komórkach, które są nosicielami nowotworowych CNV.
Odkrycia zespołu mogą mieć również wpływ na wczesne wykrywanie i leczenie choroby. „Jeśli nasza praca zakończy się sukcesem w identyfikacji cech ‘klonów zabójczych’ poprzez skupienie się na początkowych miejscach rozprzestrzeniania się, pozwoli to nam, innym pacjentom, wykorzystać te cechy do ustalenia, czy występują pewne sklonowane nowotwory prostaty, które zdecydowanie wymagają pilnego leczenia. lub Czy inni mogą w ogóle nie potrzebować leczenia, a ci mężczyźni mogą uniknąć wielu skutków ubocznych leczenia” – powiedział Lamb.
„Co ważne, nie postrzegamy tego jako zastąpienia naszego histopatologicznego podejmowania decyzji” – powiedział Lamb. „W przypadku raka prostaty system klasyfikacji Gleasona służył nam dobrze od wielu dziesięcioleci. Zamiast tego chcemy dodać podstawową warstwę szczegółów molekularno-przestrzennych, aby wypełnić pozostałe duże luki przy użyciu samej histopatologii. W ten sposób mamy nadzieję, że słuszne pacjenci otrzymują właściwe leczenie we właściwym czasie!” ”
„Odkrywca. Entuzjasta muzyki. Fan kawy. Specjalista od sieci. Miłośnik zombie.”
More Stories
Nowy raport WHO pokazuje, jak miasta przyczyniają się do postępu w zapobieganiu chorobom niezakaźnym i urazom
Naukowcy identyfikują „najlepszy punkt” bezpiecznej operacji po zawale serca
Badanie wykazało, że 20% dzieci chorych na zapalenie płuc nie otrzymuje antybiotyków