Subklonalne mutacje rakotwórcze są powszechne w nieresekowanym obrzęku otrzewnej u dorosłych z powodu glejaków rozlanych Badania nad rakiem

Rozlane glejaki u dorosłych zwykle nawracają niezależnie od leczenia. Ponieważ nawrót zwykle wynika z obrzęku otrzewnej sąsiadującego z wyciętym masowym guzem, profilowanie mutacji somatycznych z naciekających komórek złośliwych w tym krytycznym, nieresekowanym regionie może dostarczyć ważnych informacji na temat choroby resztkowej. Główną przeszkodą był brak możliwości rozróżnienia szumu sekwencjonowania nowej generacji (NGS) od rzeczywistego, ale słabego sygnału pochodzącego z komórek nowotworowych ukrytych w nienowotworowej tkance mózgowej obrzęku otrzewnej. W tym miejscu opracowaliśmy i zweryfikowaliśmy sekwencjonowanie True2 w celu zmniejszenia błędów związanych z NGS do <1 fałszywie dodatnich pozycji panelu/100 kb, wykrywając 97,6% mutacji somatycznych przy częstotliwości alleli ≥0,1%. Następnie True2 wykorzystano do badania guza i obrzęku otrzewnej 22 dorosłych glejaków rozlanych, w tym glejaka wielopostaciowego, gwiaździaka, skąpodrzewiaka i nerwiaka niskiego stopnia związanego z NF1. Guz i obrzęk otrzewnej wykazywały podobne obciążenie mutacjami, co sugeruje, że operacja usuwa te nowotwory fizycznie, ale nie molekularnie. Co więcej, warianty obrzęku otrzewnej obejmowały unikalne mutacje powodujące raka, których nie ma w guzie masowym. Wreszcie, analiza wielu próbek od każdego pacjenta ujawniła wiele subklonów z unikalnymi mutacjami w tym samym genie u 17 z 22 pacjentów, co potwierdza występowanie zbieżnej ewolucji w odpowiedzi na specyficzne dla pacjenta naciski selekcyjne w mikrośrodowisku nowotworu, które mogą leżeć u podstaw molekularnych podstaw nowotworu. rak. Częsta choroba. Łącznie True2 umożliwia wykrywanie mutacji o bardzo niskiej częstotliwości podczas analiz molekularnych glejaków rozlanych u dorosłych, co jest niezbędne do zrozumienia postępu nowotworu, nawrotów i indywidualnej odpowiedzi na leczenie.