Naukowcy próbują odkryć ewolucję omikronowego wariantu wirusa Corona

JOHANNESBURG: Wysoce zakaźny wariant Omicron, który pojawił się wraz z grupą niezwykłych mutacji pod koniec listopada zeszłego roku, został odkryty w ponad 120 krajach. Teraz naukowcy próbują dowiedzieć się, jak ewoluował.

Rozpowszechnienie wariantu Omicron na całym świecie było szybsze niż w przypadku poprzednich wersji.

Podczas gdy z jednej strony nie ma przejrzystego szlaku transmisji łączącego Omicron z jego przodkami, z drugiej strony wariant zawiera niezwykły zestaw mutacji, które ewoluowały całkowicie poza poglądem naukowców, donosi Nature.

W rzeczywistości wariant różni się tak bardzo od wcześniejszych linii genetycznych, takich jak alfa i delta, że ​​wirusolodzy ewolucyjni szacują, że najwcześniejszy znany przodek genetyczny może pochodzić ponad rok temu, gdzieś po połowie 2020 roku.

„To po prostu pojawiło się znikąd” – cytuje słowa Darrena Martina, biologa obliczeniowego z University of Cape Town w RPA.

Zrozumienie pochodzenia Omicron może pomóc naukowcom zrozumieć zagrożenia związane z pojawianiem się nowych wariantów i zasugerować kroki w celu ich zmniejszenia, powiedziała Angela Rasmussen, wirusolog z University of Saskatchewan i regulator chorób zakaźnych w Saskatoon w Kanadzie.

„Bardzo trudno jest spróbować złagodzić ryzyko, że nie będziesz w stanie poruszać się na odległość” – powiedziała.

Naukowcy odkryli trzy teorie dotyczące pochodzenia Omicrona.

Chociaż naukowcy zsekwencjonowali miliony genomów SARS-CoV-2, mogli po prostu przeoczyć serię mutacji, które ostatecznie doprowadziły do ​​powstania Omicron. Alternatywnie, wariant mógł rozwinąć mutacje u jednej osoby, jako część długotrwałej infekcji. Według raportu mógł też pojawić się niewidoczny u innych żywicieli zwierzęcych, takich jak myszy lub szczury.

Ale jak dotąd każdy pomysł, który preferuje badacz, „często wynika z przeczucia, a nie z jakichkolwiek zasadniczych argumentów”, jak powiedział Richard Nir, biolog obliczeniowy z Uniwersytetu w Bazylei w Szwajcarii.

Naukowcy są zgodni, że Omicron to nowy produkt. Po raz pierwszy odkryto go w Afryce Południowej i Botswanie na początku listopada 2021 r.; Od tego czasu testy retrospektywne wykazały wcześniejsze próbki od osób w Anglii 1 i 3 listopada oraz w RPA, Nigerii i Stanach Zjednoczonych 2 listopada.

Analiza tempa mutacji w setkach zsekwencjonowanych genomów i tego, jak szybko wirus rozprzestrzenia się w populacji do grudnia, datuje jego pojawienie się na krótko przed tym terminem – pod koniec września lub na początku października zeszłego roku.

Badanie opublikowane w Nature sugeruje, że wariant Omicron SARS-CoV-2 oddzielił się od wcześniejszych wariantów SARS-CoV-2 w wyniku ewolucji adaptacyjnej, w której korzystne mutacje są przekazywane przyszłym pokoleniom poprzez dobór naturalny, a nie poprzez rekombinację między wariantami.

„Wyniki sugerują, że Omicron jest prawdopodobnie wynikiem procesu ewolucyjnego, który stworzył wysoce zakaźnego wirusa, który częściowo unika odpowiedzi naszych przeciwciał” – powiedzieli naukowcy.